学校下设19个学院、1个教学部、14个独立研究机构；有应用经济学、理论经济学、工商管理、统计学4个一级学科博士点及博士后流动站；一级学科硕士点12个，专业学位硕士点15个、本科专业63个；已挂牌省级重点学科10个，省级重点培育学科1个，省级优势特色重点建设学科2个，6个省级高峰高原学科及方向，是云南省覆盖经济学和管理学硕士授权点最集中、最全面的学校之一。现有：国家级：一流本科专业建设点11个、特色专业4个、精品课程1门、精品视频公开课1门、双语教学示范课程1门、来华留学英语授课品牌课程1门、国际会计人才培养模式创新实验区1个；教学成果奖1项。省级：一流本科专业建设点5个、特色专业5个，重点建设专业7个、品牌专业5个、综合改革试点专业4个、人才培养模式改革试点专业1个，人才培养模式创新实验区4个、区域经济合作国际人才培养基地1个、重点教学实验室1个、实验教学示范中心5个、虚拟仿真实验教学中心2个、虚拟仿真实验教学项目3个、精品课程30门；教学成果奖23项。

“十四五”期间，每个院系都制定了自己的发展规划，每个学科也都有自己特定的发展需求。为适应新时期下不同院系的发展需要，云南财经大学教育发展基金会携手各个院系开展筹款活动，以支持院系的发展。